Prologue : Une nouvelle guerre sainte
Fuyuki City, maison des Emiya, la nuit.
Une jeune femme aux cheveux blancs dort. Mais son sommeil est troublé par des rêves... Des évènements étranges, survenus dix ans auparavant... Des personnages mythiques, se battant les uns contre les autres afin de pouvoir exaucer leurs souhaits... Un colosse à douze résurrections, une jeune femme maniant une épée invisible, un héros maniant la lance à la perfection, un archer épéiste, un samouraï oublié de tous, une magicienne bafouée, une gorgone antique, et un roi de Babylone... Tout à coup, les flashs changent ! De nouveaux personnages apparaissent, alors que la jeune fille ne les connait pas... Qui sont-ils ? Elle se réveilla brusquement, en ouvrant ses pupilles rouges. Elle se leva, tremblant légèrement, puis sortit dehors...
"Ce n'est donc pas fini... Dix ans après, de nouveaux Gardiens vont apparaître... Et une nouvelle guerre pour le Saint Graal va commencer !"